在操作桌面式螺丝机时，首先要确保设备通电正常，且连接稳固。接着，需要仔细查看和了解螺丝机的操作说明书，熟悉各个部件的功能和位置。在使用前，要保证工作台面整洁无障碍物，并且在周围设置好工作区域的安全警示。在操作时，应该戴好适当的防护用具，例如手套和护目镜，确保安全。
对于每一种螺丝，都需要选择适合的螺丝刀头。在更换刀头或者螺丝时，必须先关掉电源，并等待机器完全停止运转后进行操作。切勿在设备运转中进行更换，避免发生意外伤害。并且，在更换螺丝刀头时，需要对刀头进行检查，确保其完好无损。切勿使用损坏的刀头进行作业，以免影响工作效率和安全性。
在进行螺丝拧紧的过程中，需要根据螺丝的规格和工件的要求，调整好机器的扭力控制装置。这样可以确保螺丝拧紧的力度符合要求，避免因扭力过大或者过小而引起的问题。在调整扭力控制时，要小心操作，避免误操作造成设备或工件损坏。
当螺丝机长时间使用后，要定期对设备进行清洁和维护。清洁时要注意将设备断电，并使用软布擦拭机器表面和各个部件，保持干净。同时，要注意定期添加润滑油，确保机器运转顺畅。定期维护可以延长设备的使用寿命和保证其工作效率。
在使用桌面式螺丝机时，还需要特别注意防止过多的震动和噪音对周围环境和人员造成影响。如果发现设备运转异常或有噪音过大的情况，应立即停止使用并进行排除故障。另外，在长时间作业过程中，要注意适时休息，避免因连续作业过久而引发疲劳和意外。